In KILLING FLOOR 2 i giocatori dovranno avventurarsi nell'Europa continentale in cui l'epidemia, causata da un esperimento fallito della Horzine Biotech, si è diffusa rapidamente e procede inarrestabile, paralizzando di fatto l'Unione Europea. Solo un mese dopo la conclusione degli eventi del primo KILLING FLOOR, i cloni si sono diffusi dappertutto e la civiltà è allo sbando: comunicazioni interrotte, governi impotenti, forze militari sistematicamente sconfitte. La popolazione europea conosce bene l'arte della sopravvivenza e i fortunati superstiti sono costretti a vivere nascosti. Eppure non tutti hanno abbandonato la speranza. Alcuni civili e mercenari hanno unito le forze per respingere l'epidemia e stabilito in tutta Europa basi operative finanziate privatamente. Una volta rintracciate le epidemie di cloni, i giocatori dovranno calarsi nelle zone "calde", brulicanti di creature da sterminare.